指南

图表类型

每个类型都有自己的页面,包含实时演示、数据格式、代码示例和特定于类型的选项。选择一个类型深入了解。

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笛卡尔坐标

统计

金融

饼图 / 层级

流向

仪表盘 / 极坐标

其他

地图

生物信息学

火山图volcano

火山图——折叠变化(x)与统计显著性(−log10 p值,y)。点按显著性阈值着色:上调、下调、无显著性。

曼哈顿图manhattan

GWAS可视化——沿着染色体位置的点,每条染色体的颜色交替,以及全基因组显著性线。Canvas渲染超过约20k个点。

Kaplan-Meier生存曲线kaplanmeier

生存曲线(阶跃函数),可选置信区间、删失标记、风险表和中位生存线。

森林图forestplot

荟萃分析森林图,显示研究间的效应量和置信区间;正方形大小编码研究权重。

序列标识图sequencelogo

DNA/蛋白质序列标识——每个位置的堆叠字母按信息含量 / 频率调整大小。

聚类热力图clusteredheatmap

具有行和/或列层级聚类树状图的热力图——常用于基因表达分析。

系统发育树phylotree

进化关系的系统发育树——矩形或径向布局,带分支长度和自举值。

主坐标分析(PCoA)pcoa

主坐标分析 / 序数散点图,可选每组置信椭圆。

Circos图circos

圆形基因组可视化,具有多个可配置的轨道类型(直方图、散点、热力图、线条、链接)。所有circos变体的基础。

Circos热力图circosheatmap

将矩阵热力图环绕成圆环——行成为角向扇区,列成为同心圆带。适合表达量或丰度矩阵。

Circos比较图circoscomparative

多物种共线性布局——多个基因组的染色体共享一个圆环,由宽度可变的色带连接保守区域。

Circos螺旋图circosspiral

数值沿阿基米德螺旋线绘制,每个周期一圈——揭示平面坐标轴会隐藏的季节性与长期趋势。